1999年,程耳执导自己的毕业短片《犯罪分子》,并担任该片的编剧、导演、剪接。2006年,执导黑色惊悚电影《第三个人》 。2013年,凭借自编自导的犯罪情感电影《边境风云》获得第13届华语电影传媒大奖最佳新人导演奖、第15届中国电影华表奖优秀青年剧作奖。2014年,执导悬疑谍战电影《罗曼蒂克消亡史》。2017年4月,获得第8届中国电影导演协会年度导演奖。2019年10月,执导的电影《不浪漫》在第三届平遥国际电影展上首曝预告片。
1999年,程耳拍摄35mm电影短片《犯罪分子》,担任该片的编剧、导演、剪接,影片用一个看似平淡却暗藏玄机的故事刻画了现代人的重重压力和与之共生的内心善恶交锋。影片参加了1999年首届独立影像展,2001年法国克莱蒙-费朗德国际电影节短片竞赛、2001年釜山国际电影节短片竞赛、2002年加拿大多伦多国际电影节、2002年西班牙国际电影节和2003年纽约
大学电影节短片单元。
2006年,程耳执导黑色惊悚电影《第三个人》,影片采用悬疑故事的手法,以普通人平淡无奇的生活为背景,揭示出现代都市人错综复杂的内心状态。
2013年,程耳执导犯罪情感电影《边境风云》,凭借该片获得第13届华语电影传媒大奖最佳新人导演奖、第15届中国电影华表奖优秀青年剧作奖,第20届北京大学生电影节最佳编剧奖。
2014年10月,程耳执导悬疑谍战电影《罗曼蒂克消亡史》(原名《浮生如梦》),该片由章子怡、葛优主演。
2016年12月,程耳担任第二届“CFDG中国青年电影导演扶持计划”首批评审导师。
2017年4月,获得第8届中国电影导演协会年度导演奖。
2022年7月28日,2022海浪电影周官宣艺委会主席及艺委会委员,程耳担任艺委会委员。 8月,担任第6届平遥国际电影展产业单元“迁徙计划·从文学到电影“推荐委员会成员。